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Minicurso de transcriptomica

INDICE
1. INTRODUCCION A BIOINFORMATICA
1.1 INTRODUCCION A LINUX
1.2 INTRODUCCION A PYTHON
1.3 INTRODUCCION A R
1.4 ENTREZ NCBI PERL
2. BASH SCRIPTS PARA NGS
2.1 BASH PIPELINES
2.2 BASH SCRIPTS
2.3 SYNTAXIS
2.4 ARCHIVOS PARA DATOS NGS
3. ANALISIS DE DATOS NGS
3.1 SIMULACION DE READS
3.2 CONTROL CALIDAD
3.3 FILTRADO DE READS
3.4 ENSAMBLAJE
4. ANALISIS DE DATOS RNAseq
4.1 DESCARGAR SECUENCIAS
4.2 CONTROL DE CALIDAD
4.3 FILTRADO DE SECUENCIAS
4.4 FILTRADO DE rRNA
4.5 ALINEAMIENTO
4.6 CONTEO DE SECUENCIAS
4.7 IMPORTAR A R